База даних фізико-хімічних та спектральних властивостей синтезованих сполук-лідерів, перспективних інгібіторів протеаз Mpro та PLpro коронавірусу SARS CoV 2

Abstract

У даній роботі представлено серію молекулярних структур, які демонструють потенціал як інгібітори, що діють на протеази Mpro або одночасно на протеази Mpro і PLpro коронавірусу SARS-CoV-2. Було проведено in silico скринінг, фармакофорне фільтрування та молекулярний докінг еволюційної бібліотеки на основі відомого інгібітору ML300. Були створені віртуальні бібліотеки за допомогою еволюційного алгоритму. За допомогою фармакофорного фільтрування ми відібрали кандидати, які згодом були проранжовані на основі розрахунків молекулярного докінгу. Відібрані сполуки були синтезовані для подальших досліджень. Дана робота містить дані щодо загальних фізико-хімічних властивостей синтезованих сполук-лідерів, спектральні характеристики та параметри хімічної чистоти зразків.This paper presents a series of molecular structures that demonstrate potential as inhibitors acting on Mpro proteases or simultaneously on Mpro and PLpro proteases of the SARS-CoV-2 coronavirus. In silico screening, pharmacophore filtering, and molecular docking of an evolutionary library based on the known inhibitor ML300 were performed. Virtual libraries were created using an evolutionary algorithm. By using pharmacophore filtering, we selected candidates that were subsequently ranked based on molecular docking calculations. The selected compounds were synthesized for further research. This work contains data on the general physicochemical properties of the synthesized leading compounds, spectral characteristics, and chemical purity parameters of the samples.